PLoS Pathog：数据分析揭示宫颈微生物组在HR-HPV自然发展中的作用

人瘤病毒（HPV）感染是最常见的性传播疾病之一。然而，只有一小部分高危（HR）HPV感染实质性为子宫颈癌前病渐变和癌症。在这项数据归纳中所，我们调查结果了子宫颈有机物第三组（CVM）在HR-HPV人为开端中所的作用，数据归纳结果已在线出版于PLoS Pathog。

数据归纳纳入18-25岁的成年人，用于两次就医的HR-HPV感染成年人（n = 273名成年人）的子宫颈抽样评量CVM对HR-HPV人为开端中所的前瞻性作用。特别关注感染清洗、持续和实质性到子宫颈上皮内瘤渐变2级和3级（CIN2+）。用于Illumina MiSeq平台对大肠杆细菌16S V4 rRNA基因周边地区和真细菌ITS1周边地区透过扩增和测序，对CVM透过表征。用于QIIME2透过OTU聚类。用于PICRUSt推算功能第三组，并用于R透过统计归纳。

结果，在第1次访问（V1），乳酸杆细菌iners的丰度与HR-HPV感染的清洗有关（线性判别归纳（LDA）>4.0），而V1托马斯细菌是HR-HPV实质性的主要生物标志物（LDA>4.0）。在第2次访问（V2）时，有机物库珀社会性的增加与CIN2+的实质性显著涉及（P = 0.027）。多渐变数中所介归纳显示，V1托马斯细菌与CIN2+实质性的正涉及是由于V2时子宫颈社会性增加所致（p = 0.040）。CVM极为重要成分的全多渐变数模型显示，通过V1乳酸细菌旧称，OR = 0.41（0.22-0.79）、V1真细菌社会性，OR = 0.90（0.82-1.00）和V1持续性细胞运动途径，OR = 0.75（0.62-0.92）具有显著的保护作用，而V2大肠杆细菌社会性，OR = 1.19（1.03-1.38）则对CIN2+的实质性具有预测作用。

综上所述，该数据归纳数据最近，在此前瞻性纵向队列中所，子宫颈有机物第三组的相似性与HR-HPV实质性涉及。最近，托马斯细菌和实质性到CIN2+的关联实际上有可能是由随后有机物社会性的进一步提高所介导的。与HR-HPV实质性涉及的有机物第三组相似性有可能是防止CIN2+的治疗法性操作的目标。

原始出处：

Mykhaylo Usyk, Christine P Zolnik, et al., Cervicovaginal microbiome and natural history of HPV in a longitudinal study. PLoS Pathog. 2020 Mar 26;16(3):e1008376. doi: 10.1371/journal.ppat.1008376.